市、区县人民政府所属机构以及投资机构、房地产开发企业持有的公共租赁住房配租采用公开摇号、顺序选房方式进行，由区县住房保障管理部门组织摇号配租。程序如下：
(一)公共租赁住房产权单位应当在区县住房保障管理部门监督指导下，在房屋具备入住条件60天前编制配租和运营管理方案，经批准后，由区县住房保障管理部门在区县政府网站上公布配租公告，公告内容包括房源位置、套数、户型面积、工期、租金标准、租赁管理、供应对象范围、登记时限、登记地点等。家庭应在规定时限内到指定地点进行意向登记。
区县住房保障管理部门应在公共租赁住房配租房源中，选择符合廉租住房建设标准的房屋面向廉租家庭配租。
(二)区县住房保障管理部门根据意向登记家庭备案时间顺序，按房源与家庭数量比不超过1：1.2确定参加摇号入围家庭名单。
区县住房保障管理部门组织相关部门对入围家庭的收入、人口、住房等情况进行复核，经复核，仍符合公共租赁住房申请条件的家庭名单，在区县政府网站上予以公布。
(三)廉租住房、经济适用住房和限价商品住房轮候家庭优先配租;申请家庭成员中有60周岁(含)以上老人、患大病或做过大手术人员、重度残疾人员、优抚对象及退役军人、省部级以上劳动模范、成年孤儿优先配租。
(四)区县住房保障管理部门遵循公平、公开、公正原则，结合本区县实际选择下列一种方式组织公开摇号配租。
1、区县住房保障管理部门确定配租家庭范围后，按照优先家庭在前、普通家庭在后的顺序摇出家庭选房顺序号，家庭依据摇出的顺序号选房。选房工作在区县住房保障管理部门监督下，由公共租赁住房产权单位负责组织实施。
2、区县住房保障管理部门确定配租家庭范围后，可结合配租住房套型，按照优先家庭在前、普通家庭在后的顺序分组对应不同套型的房屋，直接摇出家庭顺序号及所对应的房号。
家庭退出公共租赁住房后房屋空置的，公共租赁住房产权单位可根据最近一次摇号顺序号依次递补。
(五)申请家庭选房确认后，区县住房保障管理部门向申请家庭发放《北京市公共租赁住房配租通知单》，申请家庭凭配租通知单、身份证明与公共租赁住房产权单位签订《北京市公共租赁住房租赁合同》，其中需腾退原住房的家庭应先办理完原住房腾退手续。
